Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms