Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms