Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tmod3Q9JHJ0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tmod3Q9JHJ0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tmod3Q9JHJ0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tmod3Q9JHJ0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tmod3Q9JHJ0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tmod3Q9JHJ0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tmod3Q9JHJ0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Tmod3Q9JHJ0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Tmod3Q9JHJ0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Tmod3Q9JHJ0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Tmod3Q9JHJ0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Tmod3Q9JHJ0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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