Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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