Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim54Q9ERP3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms