Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms