Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms