Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rnf6Q9DBU5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rnf6Q9DBU5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rnf6Q9DBU5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rnf6Q9DBU5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rnf6Q9DBU5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf6Q9DBU5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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