Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms