Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
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Pdzd9Q9D9M4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Pdzd9Q9D9M4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Pdzd9Q9D9M4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Pdzd9Q9D9M4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Pdzd9Q9D9M4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd9Q9D9M4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Pdzd9Q9D9M4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Pdzd9Q9D9M4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd9Q9D9M4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd9Q9D9M4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd9Q9D9M4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Pdzd9Q9D9M4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Pdzd9Q9D9M4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd9Q9D9M4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd9Q9D9M4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd9Q9D9M4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd9Q9D9M4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd9Q9D9M4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd9Q9D9M4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd9Q9D9M4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd9Q9D9M4 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd9Q9D9M4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd9Q9D9M4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd9Q9D9M4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd9Q9D9M4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd9Q9D9M4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd9Q9D9M4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd9Q9D9M4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms