Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifi35Q9D8C4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms