Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms