Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ttc9bQ9D6E4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ttc9bQ9D6E4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ttc9bQ9D6E4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ttc9bQ9D6E4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ttc9bQ9D6E4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc9bQ9D6E4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc9bQ9D6E4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc9bQ9D6E4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc9bQ9D6E4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ttc9bQ9D6E4 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ttc9bQ9D6E4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ttc9bQ9D6E4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ttc9bQ9D6E4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ttc9bQ9D6E4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9bQ9D6E4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ttc9bQ9D6E4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9bQ9D6E4 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9bQ9D6E4 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9bQ9D6E4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9bQ9D6E4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9bQ9D6E4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9bQ9D6E4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9bQ9D6E4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9bQ9D6E4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9bQ9D6E4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9bQ9D6E4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9bQ9D6E4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9bQ9D6E4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9bQ9D6E4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9bQ9D6E4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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