Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdr42e1Q9D665 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms