Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm3404Q9D506 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm3404Q9D506 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm3404Q9D506 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm3404Q9D506 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm3404Q9D506 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm3404Q9D506 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm3404Q9D506 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm3404Q9D506 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm3404Q9D506 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3404Q9D506 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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