Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Phf6Q9D4J7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Phf6Q9D4J7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf6Q9D4J7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf6Q9D4J7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf6Q9D4J7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf6Q9D4J7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf6Q9D4J7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf6Q9D4J7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Phf6Q9D4J7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms