Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rufy3Q9D394 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms