Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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