Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2N9

Vps33a, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33aQ9D2N9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vps33aQ9D2N9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vps33aQ9D2N9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms