Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hddc3Q9D114 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms