Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Y8

Mrpl52, 39S ribosomal protein L52, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl52Q9D0Y8 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl52Q9D0Y8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms