Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Mms19Q9D071 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Mms19Q9D071 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Mms19Q9D071 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mms19Q9D071 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Mms19Q9D071 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mms19Q9D071 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mms19Q9D071 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mms19Q9D071 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mms19Q9D071 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mms19Q9D071 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Mms19Q9D071 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mms19Q9D071 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mms19Q9D071 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mms19Q9D071 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mms19Q9D071 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mms19Q9D071 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mms19Q9D071 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Mms19Q9D071 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mms19Q9D071 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Mms19Q9D071 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Mms19Q9D071 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Mms19Q9D071 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mms19Q9D071 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mms19Q9D071 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mms19Q9D071 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Mms19Q9D071 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Mms19Q9D071 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Mms19Q9D071 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mms19Q9D071 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mms19Q9D071 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mms19Q9D071 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Mms19Q9D071 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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