Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ccdc47Q9D024 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ccdc47Q9D024 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ccdc47Q9D024 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc47Q9D024 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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