Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shmt2Q9CZN7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms