Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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