Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXZ1

Ndufs4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs4Q9CXZ1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs4Q9CXZ1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms