Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl11Q9CXW4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms