Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Utp23Q9CX11 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms