Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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