Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx47Q9CWX9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ddx47Q9CWX9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx47Q9CWX9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ddx47Q9CWX9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ddx47Q9CWX9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ddx47Q9CWX9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ddx47Q9CWX9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ddx47Q9CWX9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ddx47Q9CWX9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ddx47Q9CWX9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ddx47Q9CWX9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ddx47Q9CWX9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ddx47Q9CWX9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ddx47Q9CWX9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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