Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxxc1Q9CWW7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms