Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms