Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms