Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Otud1Q9CUB6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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Otud1Q9CUB6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otud1Q9CUB6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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