Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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