Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
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Ykt6Q9CQW1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ykt6Q9CQW1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ykt6Q9CQW1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ykt6Q9CQW1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ykt6Q9CQW1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ykt6Q9CQW1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ykt6Q9CQW1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ykt6Q9CQW1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ykt6Q9CQW1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ykt6Q9CQW1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Ykt6Q9CQW1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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