Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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PompQ9CQT5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PompQ9CQT5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms