Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms