Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms