Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms