Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQC3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQC3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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