Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Chchd1Q9CQA6 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Chchd1Q9CQA6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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