Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpa3Q9CQ71 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms