Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms