Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim26Q99PN3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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