Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rassf3Q99P51 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms