Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gtf2ird2Q99NI3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gtf2ird2Q99NI3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gtf2ird2Q99NI3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gtf2ird2Q99NI3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gtf2ird2Q99NI3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gtf2ird2Q99NI3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gtf2ird2Q99NI3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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