Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubqln4Q99NB8 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms