Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Atoh8Q99NA2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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