Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms